依照房屋稅條例第7條規定，房屋有增建、改建或變更使用時，均應向當地主管稽徵機關申報，以便稅捐機關更正稅籍核實課稅，但一般民眾大多未依規定向稅捐機關申報。該處表示，第2波的清查行動已從6月1日展開，將持續到11月底為止，除了派員實地勘查以加強查核房屋增建、改建及使用情形外，對於營業用房屋也將查核其是否有擴大營業使用面積或樓層之情形；另外對於已核准免徵或減徵房屋稅之房屋，如工廠廠房、私立學校之校舍…等，均將查核其是否仍符合減免規定。
清查中如發現有增改建、變更營業或非住家使用及不符減免規定等情形而應增課、改課或恢復課稅者，稅捐處將發函通知房屋稅納稅義務人（所有人、現住人或使用人），對通知內容如有異議，請於收到通知函30日內向該處提出申覆。
