本市加工出口區公司電詢，該公司98年度申報營業費用研究費4,500萬，當年度有政府補助款收入1,008萬元，因公司適用研究與發展支出投資抵減金額1,960萬元，所以扣除之政府補助收入係按比例計算，這樣的作法是否正確？
高雄市國稅局答復，依「公司研究與發展及人才培訓支出適用投資抵減辦法」第7條規定，公司適用投資抵減稅額之研究與發展及人才培訓之支出，不包括政府補助款在內，且應以稅捐稽徵機關核定數為準。本案該公司說明，結算申報時申報營業費用研究費4,500萬元，適用投資抵減稅額之研究與發展支出1,960萬元，扣除依比例計算補助收入4,390,400元（1,008萬*1,960萬/4,500萬）後，申報適用投資抵減稅額之研究與發展支出15,209,600元。惟此申報核算方式顯與上揭規定不符，國稅局查核時會予調整。
國稅局進一步表示，公司申報營業費用之研究費，不一定能適用投資抵減稅額之研究與發展支出，是以兩者金額可能不一致；申報適用投資抵減稅額之研究與發展支出，原則上應扣除政府補助款總額，惟如各研究計畫之研究人員與計畫各自獨立，能明確依研究計畫類別分別提供政府補助之研發成果報告書、專責人員及工作細項等支出明細，以佐證取得補助款之計畫未申報於研發投抵中，始得免自研發投抵之研發支出金額項下扣除外，其他均需扣除當期全額補助款收入。
以本案為例，列報研發投抵之研發支出1,960萬元，若取得政府補助款收入1,008萬元之計畫，已申報研發投抵，即需以減除1,008萬元後之餘額952萬元作為本期適用研發投抵之研發支出；若該計畫未申報研發投抵，則該計畫之補助款始得免自研發投抵之研發支出金額項下扣除。【＃327】
新聞稿提供單位：高雄加工出口區稽徵所
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