依廢止前促進產業升級條例(以下簡稱廢止前促產條例)第9條第1項規定，公司符合新興重要策略性產業適用範圍，且選擇適用免徵營利事業所得稅者，依同條例施行細則第19條規定，應於其投資計畫完成之次日起1年內檢齊文件，向財政部申請5年免徵營利事業所得稅。
財政部臺灣省南區國稅局表示，同條例施行細則第20條亦規定，公司如未能於規定期限內檢齊文件者，得於期限屆滿前申請，可延至期限屆滿之次日起90日內補送；若公司逾期提出申請者，財政部仍就賸餘之期間核定適用獎勵。賸餘期間，自文件檢齊之當日起算。
該局進一步說明，轄內某公司符合新興重要策略性產業之適用範圍，且依規定選定適用5年免徵營利事業所得稅，並已取得經濟部工業局核發之完成證明函，因完成證明所載投資計畫完成日為95年7月31日，依規定公司應於96年7月31日以前檢附文件向財政部申請5年（自95年7月31日至100年7月30日止）免徵營利事所得稅；公司未能於期限內檢齊文件，亦未申請延期補證，遲至98年4月13日始提出申請。財政部乃核定該公司自文件檢齊之日98年4月13日起至100年7月12日止，計賸餘期間2年3個月，自投資計畫完成之日95年7月31日起連續2年3個月內就其新增所得免徵營利事業所得稅。
該局特別提醒公司，依廢止前促產條例第9條第1項規定選擇適用免徵營利事業所得稅者，請記得於規定期限內向財政部申請5年免徵營利事所得稅，以免像本案例公司原來五年免稅期間只剩2年3個月，應享受之租稅優惠打折，權益受損！
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彙總編號：10004-1103
