財政部臺灣省北區國稅局表示，部分扣繳單位給付權利金或租金時，依照契約約定由扣繳單位負擔稅款，但誤以未含稅的金額辦理扣繳，以致短扣稅款而受罰。
該局指出，依所得稅法的規定，納稅義務人各類所得，應由扣繳義務人在給付時，依規定的扣繳率或扣繳辦法扣取稅款，並依規定繳納之。本國營利事業給付國外營利事業權利金，應在給付權利金時自給付金額中扣取20﹪的稅款，再將餘款交付給國外營利事業；但發現有於契約約定由國內營利事業負擔扣繳稅款情形，此時就必須按國外營利事業實際取得的權利金總額來計算扣繳稅款。
該局舉例說明，國內甲公司使用外國乙公司的專利權，甲乙公司約定，有關須繳付我國的稅捐由甲公司負擔，乙公司每次收取100萬元。則甲公司在給付乙公司權利金時，應按乙公司收取100萬元之淨額換算給付總額125萬元【100萬元÷（1-20﹪）】，再以給付總額乘以扣繳率20﹪，申報及繳納扣繳稅款25萬元。此外，也常見有出租人與承租人約定，租賃所得的扣繳稅款由承租人自行負擔的情形，承租人在辦理扣繳時，也要先換算出正確的給付總額再辦理扣繳，才不會造成短扣稅款。
該局進一步表示，扣繳義務人未依規定扣繳稅款者，除限期責令補繳應扣未扣或短扣之稅款及補報扣繳憑單外，並按應扣未扣或短扣之稅額處一倍之罰鍰，其未於期限內補繳應扣未扣或短扣之稅款，或不按實補報扣繳憑單者，應按應扣未扣或短扣之稅額處三倍之罰鍰。請扣繳義務人注意正確計算扣繳稅款，避免受罰，以維自身權益。
