財政部臺灣省南區國稅局表示，轄內有一王姓納稅義務人申報94年度綜合所得稅，將其轉讓技術作價投資取得之甲公司股票8,500,000股（每股面額10元），按半數計算財產交易收入並扣除成本及必要費用後，列報財產交易所得29,750,000元。該局以王君94年度移轉系爭股票，未符合促進產業升級條例第11條規定，乃按每股面額10元計算王君財產交易收入85,000,000元，減除30﹪成本及必要費用，核定財產交易所得59,500,000元。
王君不服，主張其92年間以專利權作價取得甲公司股份，嗣94年度轉讓股票8,500,000股，收入總額85,000,000元，依促進產業升級條例第11條規定，上開收入得半數免稅，94年度以收入之半數即42,500,000元並扣除30﹪成本及必要費用後申報財產交易所得，符合法令規定為由，資為爭議。案經復查駁回並確定在案。
該局復查決定略以，查王君92年與甲公司簽訂協議書，約定以
其所有經中華徵信所企業股份有限公司鑑價之A專利權價值150,000,000元「抵繳甲公司增資股款」，並取得該公司股票15,000,000股，嗣94年間將上開股票移轉8,500,000股予第3人，依財政部75年9月12日台財稅第7564235號函及94年10月6日台財稅字第09404571980號令：「公司股東以專門技術作價投資，‧‧‧股東於取得該項股票後以之轉讓時，應就其面額部分減除原專門技術之取得成本後，以其差額為財產交易所得課徵所得稅。」及「92年12月31日以前以專門技術作價投資之案件，該專門技術財產交易所得之計算，應依本部75年9月12日台財稅第7564235號函規定辦理；至該專門技術之成本及必要費用，納稅義務人未申報或未能提出成本、費用之證明文件者，得按股票面額之30%計算。」規定，本件應就面額部分減除原專門技術之取得成本後，課徵財產交易所得，是原核按王君移轉專門技術作價所取得之股票面額85,000,000元，減除30%成本及必要費用，核定財產交易所得59,500,000元，並無不合，乃復查予以駁回。
該局強調，促進產業升級條例第11條之稅捐優惠規定，係以專利權之「提供」或「出售」予中華民國境內公司使用為要件，就該公司使用所得之權利金，或售予該公司使用所得之收入為稅捐優惠對象，非汎就一切「轉讓」專利權予國內公司之對價半數免稅。基於租稅法定原則，王君轉讓系爭專利權既本於「股東出資」行為，即不符合該條所指之稅捐優惠要件，尚非得據為半數免稅之依據。
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