依據所得稅法第75條第1項規定：「營利事業遇有解散、廢止、合併或轉讓情事時，應於截至解散、廢止、合併或轉讓之日止，辦理當期決算，於45日內，依規定格式，向該管稽徵機關申報其營利事業所得額及應納稅額，並於提出申報前自行繳納之。」因上開條文並未明定「45日內」的起算日，以往財政部函釋規定係以「主管機關核准之日為準起算」，為避免造成徵納雙方適用爭議，財政部已參酌行政程序法第48條第2項有關「期間以日、星期、月或年計算者，其始日不計算在內」的規定，於97年1月24日以台財稅字第09604136230號令核釋該起算日應自主管機關核准之「次日」起算。
該局舉例說明：甲公司(存續公司)合併乙公司(消滅公司)，經濟部之核准函日期為96年12月21日，甲公司應於自96年12月22日起算45日內提出申報，亦即應於97年2月4日以前提出申報並繳納稅款。另存續公司繳納消滅公司合併前之應納營利事業所得稅額，得依所得稅法第66條之3第1項第1款規定，計入存續公司的股東可扣抵稅額帳戶。
該局呼籲，前揭決算申報期限並無延期申報的規定。營利事業遇有解散、廢止、合併或轉讓情事時，應按規定期限辦理決算申報，以免遭補稅及加徵滯納金。
