政府為鼓勵公司從事研究與發展及人才培訓，以促進產業升級，提升國際競爭力，訂有租稅優惠措施，公司之研發支出或人才培訓支出符合規定者，即可依抵減稅率計算抵減稅額，享受抵稅之優惠。然公司從事研究發展計畫，若有向相關主管機關申請研究補助，並取得政府補助款，除應列報為其他收入外，因該補助款非屬公司自有資金支出，不能適用投資抵減，應自研究發展支出中扣除。
南區國稅局轄內即有某公司94年度經經濟部核准某研究計畫，並取得經濟部給付之專案計畫補助款150萬元，公司雖已依規定申報為其他收入，但於當年度列報研發支出投資抵減金額550萬元中，未予扣除該筆補助款收入，該局乃核定適用投資抵減之研發支出為400萬元，可抵減稅額120萬元，補徵稅額45萬元。
該局呼籲，公司申報適用抵稅優惠之研究發展支出時，應特別注意，如有取得政府之相關補助款，除列入其他收入申報外，應自研究發展支出中扣除，俾免遭剔除補稅。
如有疑問請洽：
法務一科郭科長，聯絡電話： 06-2298066 彙總編號：97061706
