財政部臺北市國稅局表示，有營利事業來電詢問，員工因公司未依勞動基準法規定終止勞動契約而提起訴訟，經法院裁判勝訴，公司於員工復職時一次支付停職期間的薪資如何辦理扣繳？
該局說明，員工於復職時，由公司一次補發停職期間之薪資所得，均屬實際補發年度的所得，扣繳義務人應於給付時，依規定的扣繳率扣取稅款，並於次年1月底前開具扣繳暨免扣繳憑單，向所轄稽徵機關辦理申報。扣繳義務人於填發扣繳暨免扣繳憑單給員工時，應同時填具補發各年度薪資所得明細表予員工。
該局指出，員工領取一次補發停職期間之薪資所得，其屬補發以前年度部分，員工應於辦理復職當年度綜合所得稅結算申報時，於申報書中註明補發的事實及金額，除檢附相關的扣繳暨免扣繳憑單外，並應檢附補發各年度薪資所得明細表，供稽徵機關依所得人各年度適用之綜合所得稅率計算補徵稅額，彙總一次發單補徵復職年度的綜合所得稅。
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