南區國稅局表示，稽徵機關進行調查或復查時，納稅義務人未提示有關各種證明所得額之帳簿、文據者，如其帳證非屬因遭受不可抗力災害致滅失的情形，稽徵機關得依查得的資料或同業利潤標準，核定其所得額。
甲公司89年度營利事業所得稅結算申報，原核定營業收入淨額6千5百多萬元，課稅所得額77萬元，嗣被查獲當年度漏報營業收入1千6百多萬元，經國稅局發函調帳查核，甲公司未提示帳證，並出具說明書同意就漏報營業收入部分按同業利潤標準毛利率核定
營業成本，該局乃重行核定課稅所得額4百40多萬元。甲公司主張其相關帳簿憑證到復查調帳時，已超過法定5年保存期限，不須提示供核，國稅局應可比照營利事業所得稅查核準則第11條規定，以其前3年經核定的平均純益率，核定所得額等理由，提起行政救濟，但遭行政法院判決敗訴。
行政法院判決理由指出，依稅捐稽徵機關管理營利事業會計帳簿憑證辦法第26條第1項及第27條第1項規定，帳簿及會計憑證應「至少」保存10年及5年，而甲公司既已提起行政救濟，尚未確定，自應善盡保存帳證的義務，且該公司在國稅局調查時，無法提示足以正確計算其所得的相關帳證，又沒有因遭受不可抗力災害致帳簿滅失的情形，當無查核準則第11條規定的適用，因此判決甲公司敗訴。
該局補充說明，營利事業除因不可抗力的災害，導致帳證損毀或滅失，報經主管稽徵機關查明屬實者外，應於稽徵機關進行調查或復查時，提示有關各種證明所得額的帳簿、文據供核，否則稽徵機關將依查得資料或同業利潤標準，核定其所得額，因此，營利事業應注意帳證的完好保存，以免影響自身權益。
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