財政部臺灣省南區國稅局表示，公司屬獨立的法人組織，其資金若與經營者或股東等個人的資金不分，而有相互流用的情形，將涉有被設算公司利息收入，課徵營利事業所得稅的情事。
該局進一步說明，原於營利事業所得稅查核準則第36條之1規定公司之資金貸與股東或他人而未收取利息等情形，應予設算公司利息收入，課徵營利事業所得稅。嗣經大法官會議第650號解釋認為該規定欠缺所得稅法之明確授權，增加納稅義務人法律所無之租稅義務，與憲法第19條人民依法律納稅義務之規定意旨不符，宣告自97年10月31日起失其效力。惟為防杜公司將其資金貸與他人未收取利息，或約定之利息偏低，損及公司資金調度及營運利益之情形，所得稅法已於98年5月27日增訂公布第24條之3，規定公司資金遭挪用或貸與他人未收取息，或約定之利息偏低者，除屬預支職工薪資者外，應按資金貸與期間所屬年度1月1日臺灣銀行之基準利率計算公司利息收入課稅。
國稅局特別呼籲，各公司資金運用時，應注意上述規定，以免被設算利息收入，增加租稅負擔。
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