本局表示：營業稅銷售額與稅額申報書（401、403、404）格式及填寫說明，業奉財政部核定修正，並自98年8月1日起使用，營業人申報營業稅，自該日起須以修正後之申報書格式辦理申報；以網路或媒體方式辦理申報者，並應依據財政部98年3月18日修正公布「營業稅電子資料申報繳稅作業要點」規定之檔案格式辦理申報。
本局說明：本次主要是配合記帳士法修正及因應民國100年後3位數年序調整，營業人銷售額與稅額申報書格式增加申報人申辦情形欄位，申報人務必依自行申報或委任申報擇一詳實填寫姓名、身分證統一編號及電話，委任申報並應填寫主管機關核准之登錄文號或登錄字號。
本局進一步說明：為考量個人資料保護，營業稅網路申報案件，營業人將資料上傳時，均會以加密方式傳送，申報後所列印之申報書回執聯，身分證統一編號後4碼均以「＊」代替。財政部財稅資料中心並已修正相關程式，營業人不論採網路、媒體或人工方式申報營業稅，國稅局列印產出之申報書身分證統一編號後4碼均會以「＊」代替，不會造成個人資料之外洩。
本局並呼籲，營業稅申報除由本事業或關係企業單位自行申報外，以符合相關法律規定得受委任辦理申報之代理人為限。
