房屋稅從日據時代即已徵收，當時稱為家屋稅，由於課徵歷史悠久，房屋稅籍證明，常作為申請案件事實之佐證，如國有財產法第五十二條之二規定：「非公用財產類之不動產，於民國三十五年十二月三十一日以前已供建築、居住使用至今者，其直接使用人得於民國一百零四年一月十三日前，檢具有關證明文件，向財政部國有財產局或所屬分支機構申請讓售。經核准者，其土地面積在五百平方公尺以內部分，得按第一次公告土地現值計價」，除了上述的用途外，房屋若在民國六十年十二月二十五日建築法修正公布生效日前興建，可根據房屋稅籍證明申請接水或接電；其房屋基地在都市計畫外，亦可檢附房屋稅籍證明，向地政機關申請變更為特定農業區之甲種建築用地，或鄉村區之乙種建築用地；即以此次88水災為例，政府發放補償金亦以房屋所有人為發放對象，因此房屋稅籍除作為稅捐機關課稅之依據外，稅捐機關並提供民眾申請房屋稅籍證明，作為申請事實之佐證；因此民眾如於房屋增、改建時應記得應於增、改建完成時30日內向稅捐稽徵機關辦理申報，以免無法核發稅籍，而喪失上述權益。
依稅捐稽徵法第33條之規定，稽徵機關對於納稅義務人提供之課稅資料，應絕對保守秘密，因此申請房屋稅籍證明，必須是納稅義務人本人或其繼承人、授權之代理人；因此申請房屋稅籍證明，應由納稅義務人本人申請，申請時需攜帶國民身證及印章，若本人沒空也可委託他人代為申請，惟受託人應檢附委託人之授權書及身分證影本，並需攜帶身分證及印章向地方稅務局之服務台申請，該項申請採隨到隨辦，納稅人只須等候約5分鐘即可領到房屋稅籍證明。
